Urodził się 1 grudnia 1962 roku w Gdańsku. Dyplom lekarza medycyny uzyskał w 1987 r. na Wydziale Lekarskim Akademii Medycznej w Gdańsku. Od 1987 r. pracuje na etacie naukowo-dydaktycznym w Klinice Ortopedii. Stopień naukowy doktora nauk medycznych uzyskał w 1997 r. Stopień naukowy doktora habilitowanego nauk medycznych przyznano mu w 2013 r. Kierownik Katedry i Kliniki Ortopedii i Traumatologii Narządu Ruchu Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego od 2013 r., a od 2014 r. jest konsultantem wojewódzkim w zakresie Ortopedii i Traumatologii Narządu Ruchu województwa pomorskiego. Główne zainteresowania naukowe dr. Tomasza Mazurka to chirurgia ręki, mikrochirurgia i ortopedia dziecięca. Owocem tych zainteresowań było przeprowadzenie pierwszej replantacji (kciuk) w Klinice Ortopedii w 1993 r. oraz wprowadzenie nowoczesnych technik operacyjnych, takich jak przeszczepy unaczynione, rekonstrukcje w zakresie urazów i chorób nadgarstka, zastosowanie metody Ilizarowa w wydłużaniu kończyn, śródszpikowe gwoździowanie kości długich u dorosłych i dzieci, nowoczesne leczenie stopy końsko-szpotawej w postaci całkowitego uwolnienia podskokowego i metody Ponsetiego czy kompleksowego leczenia dzieci z mózgowym porażeniem dziecięcym. Najszerszy wymiar w pracy naukowo-badawczej dr. Tomasza Mazurka zajmuje problem leczenia urazów i chorób ścięgien. Owocem tych dociekań naukowych jest stworzenie protezy ścięgna własnego pomysłu w rekonstrukcji ścięgien zginaczy palców ręki, prace biomechaniczne dotyczące wytrzymałości zespoleń ścięgien oraz prace biomechaniczne poświęcone badaniu wytrzymałości połączenia przeszczepu ścięgna z paliczkiem kostnym palca ręki. W życiu pozazawodowym ojciec czworga dzieci, który każdą wolną chwilę spędza zimą na nartach, a latem na desce windsurfingowej.